Datenanalyse
Auf Grund unserer besonderen Expertise im Bereich Proteinanalytik & Proteomik, sind wir in der Lage eine Reihe qualitativ hochwertiger analytischer Dienstleistungen anzubieten:
2D-Gelbildanalyse
Erstellung von 2D-Gel-Datenbanken
Erstellung von 2D-Gel-Datenbanken mit Melanie (Swiss Institute for Bioinformatics) bzw. ImageMasterTM 2D Platinum. Diese Proteom-Datenbanken sind vollständig gematcht, d.h. die Bildung korrespondierender Spotpaare ist für alle möglichen Gelkombinationen durchgeführt worden. Deshalb kann die Zugehörigkeit der Gele zu Klassen (Kontrolle, Behandlung, Krankheit, Geschlecht, Alter, ...) beliebig variiert werden.
Da während des Matchings jedes Gel einmal als "Referenzgel" verwendet wird, sind alle Protein- spots, die wenigstens n-mal (n=3, Standardwert) im Matchset vorhanden sind, als eigene Spot- gruppe in der Proteomdatenbank repräsentiert.
Proteome Consult hat Erfahrung in der Erstellung großer 2D-Gel-Datenbanken. Datenbanken mit mehr als 250 Gelen und >106 Proteinspots können problemlos vollständig gematcht werden. Dabei ist es nicht notwendig intermediäre Mittelwert-Gele zu bilden.
Bildanalyse im Hochdurchsatz
Für Kunden, die besonderen Wert auf kurze Prozessierungszeiten bei hohem Gelaufkommen legen und das derzeit beste verfügbare Spot- quantifizierungsmodell nutzen wollen, bietet Proteome Consult 2D-Gelbildanalyse mit der Ludesi AB 2D-Gel Analyser -Software an. Fragen Sie uns nach unseren besonderen Konditionen für diesen Service!
Sie benötigen ein Angebot?
Der Arbeitsaufwand für die Erstellung von 2D-Gel-Datenbanken hängt stark von Parametern, wie Gel zu Gelreproduzierbarkeit, Art und Qualität der ver- wendeten Proteinfärbung, Spotzahlen, Anzahl und Art der Artefakte, sowie von der Reproduzierbar- keit des Spotpatterns über das gesamte Matchset und natürlich von der Gesamtzahl der zu matchenden 2D-Gele ab.
Um Ihnen ein genaues Angebot machen zu können, benötigen wir eine Auswahl von ca. 50% aller zu matchenden Gele, mindestens jedoch ein repräsen- tatives Gelbild (TIF) jeder Behandlungsklasse.
ImageMasterTM ist ein Warenzeichen von Amersham Biosciences AB, Uppsala (Sweden)