Beratungsleistungen

Laborausstattung

Proteome Consults unterstützt Sie bei der Ausstattung Ihres proteinanalytischen Labors.

Wir beraten Sie so, dass Sie in der Lage sind, die für Ihre Forschungszwecke am besten geeignete Ausrüstung zu wählen, unterstützen Sie bei Implementierung und Optimierung von experimentellen Vorschriften und übernehmen die Weiterbildung Ihres Personal in den neuen Techniken.

Wir freuen uns darauf Sie bei der Lösung Ihrer Herausforderungen zu unterstützen!

Laborvorschriften

"2D-Gelauswertung - methodischer Check" - Strategien zur Optimierung der Spotquantifizierung von 2D-Gelen.

Wenn Sie den Eindruck haben, dass Ihnen die interessantesten Spotgruppen bei der Auswertung Ihrer 2D-Gele verloren gehen, gibt es eine ganze Reihe von Parametern, die optimiert werden können. Eine kritische Bestandsaufnahme von Probenvorbereitung, 2D-Gelmethodik und Software-gestützter 2D-Gelbildanalyse kann helfen, Ihr Forschungsziel zu erreichen.

"HSC-Protein-Mass-Fingerprinting" - Verbesserung der Sequenzabdeckung bei der MALDI-MS Protein- identifizierung aus 2D-Gel-Spots.

MALDI-Mass-Fingerprinting ist die Methode der Wahl für 2D-Gel-basierte Proteomestudien, wenn es darum geht möglichst viele Proteine zu identifizieren, da sie sub-fmol-Empfindlichkeit und einen Durchsatz von mehr als 1000 Proben/Instrument und Tag in sich vereint.

Eine proteomeweit hohe Proteinidentifikationsrate setzt aber voraus, speziell für kleinere Proteine, dass jeder vermeidmare Verlust charakteristischer Peptide auch tatsächlich vermieden wird. Leider erfüllen viele Probenvorbereitungs- protokolle genau diese Forderung nicht angemessen.

Unser neu entwickeltes High-Sequence-Coverage- Protein-Mass-Fingerprinting Protokoll wird Ihnen helfen Ihre Proteinidentifikationsrate aus 2D-Gelspots wesentlich zu verbessern, da das HSC-Protokoll in der Lage ist, eine höhere Anzahl unterschiedlicher Peptide auf das MALDI-Target transferrieren, was zu einer besseren Sequenzabdeckung, einer höheren Identifizierungswahrscheinlichkeit und einem signifikanteren Mascot-Score führt.

Da das HSC-Protokoll zudem einfacher auszuführen ist als andere MALDI-MS Probenvorbereitungsprotokolle ist es leichter automatisierbar. Da keinerlei C18-Materialien verwendet werden trägt das HSC-Protokoll darüber hinaus zur Kostenreduzierung im Bereich der Verbrauchsmaterialien bei.